Im Sommer 2022 fand mit der Zusammenführung des Schulbereichs für geistige und mehrfache Behinderung im Schulhaus Granatenbaumgut und dem Wechsel des Schulbereichs Körperbehinderung und tiefgreifende Entwicklungsstörung im Gegenzug in das Schulhaus Sandacker die grösste Reorganisation seit Bestehen der Schaffhauser Sonderschulen statt.
Das Geschäftsjahr 2022 war das 18. Jahr der Schaffhauser Sonderschulen als selbständige öffentlich-rechtliche Anstalt. Die Zusammenarbeit zwischen dem Kanton und den Schaffhauser Sonderschulen ist über eine vierjährige Leistungsvereinbarung geregelt.